Chemtool - 2D-редактор для рисования химических соединений под X11 (используется GTK+). Он поддерживает много стилей соединения, большую часть видов отображения текста, используемых в химии и сплайновые/дуговые/кривые стрелки.
Рисунки можно экспортировать в форматы MOL и PDB, для дальнейшего описания - в SVG или XFig, в виде рисунков PiCTeX, в растровые или Postscript файлы (для некоторых операций используется программа из XFig -- transfig).
Также пакет содержит вспомогательную программу, cht, для вычисления формул и (точного) молекулярного веса нарисованного элемента файла chemtool. Cht может вызываться прямо из Chemtool или из консоли.

Система компьютерной алгебры Maxima - имеет широчайший набор средств для проведения аналитических вычислений, численных вычислений и построения графиков.
По набору возможностей система близка к таким коммерческим системам как Maple и Mathematica.
Это единственная из существующих систем аналитических вычислений, которая может работать на всех основных современных операционных системах на компьютерах, начиная от самых мощных вплоть до наладонных компьютеров

изображение точного графического моделирования ночного неба, из любого места на Земле, на любую дату и время. Дисплей включает 130000 звезд, 13000 объектов глубокого космоса, все 8 планет, Солнца и Луны, и тысячи комет и астероидов. он включает в себя инструменты для астрономических вычислений и может контролировать телескопы и камер

KmPlot является мощным математическим KDE плоттер, способный в заговоре несколько функций одновременно и объединение их в новых функций.
Декартовых, параметрических и дифференциальной функции поддерживаются, а также функции в полярных координатах. Участки будут напечатаны с высокой точностью при правильной пропорции. KmPlot также предоставляет численного и визуальные возможности, такие как заполнение и расчет районе между сюжетом и первой оси, найти максимумы и минимумы, изменение параметров функции динамически, и построения производных и интегральных функций

Компьютерная программа, предназначенная для визуализации молекул и используемая преимущественно для изучения и получения изображений пространственных структур биологических макромолекул, в первую очередь белков и нуклеиновых кислот.
Начиная с версий серии 2.7, RasMol распространяется по двойной лицензии (GPL или RASLIC). Тем самым, RasMol (наряду с Jmol и PyMOL) — одна из немногих программ визуализации молекул с открытым кодом.
RasMol остаётся лучшей из учебных программ визуализации молекул; кроме того, несмотря на наличие более сложных аналогов, продолжает активно использоваться молекулярными биологами и биоинформатиками. Благодаря простой и логичной структуре пользовательского интерфейса, программа проста для освоения. Система команд ("язык" RasMol'а) используется в других программах, например, в Jmol.
Исходными данными для визуализации служат координаты атомов молекулы (или комплекса молекул), содержащиеся в файле формата Protein Data Bank (PDB). Файлы с координатами атомов могут быть скопированы с одного из сайтов PDB

— это рисованная игра-головоломка в духе (пожалуй, и стиле) игры Crayon Physics, в которой используется тот же отличный движок Box2D. В ней соединены забавная, как в ученической тетради, графика и весьма реалистичный физический игровой движок.
Имеется встроенный редактор, при помощи которого можно построить свои собственные уровни и поделиться ими с другими игроками

QElectroTech - проектирование (рисование, редактирование) электрических схем. При её использовании можно в течении нескольких минут нарисовать несложную электрическую или электронную схему.
Имеет большой набор функциональных элементов, а также новые элементы схем можно создавать самому и добавлять их в библиотеку элементов, чтобы потом использовать в своих проектах.
Для создания электросхемы достаточно выбрать нужный компонент из списка в левой колонке и мышкой перетащить выбранный элемент на основное поле программы. В итоге он будет зафиксирован в нужном месте на сетке. Далее нужно просто мышкой сделать связи (проводники) между имеющимися электрическими, электронными элементами схемы, что в итоге образует полноценную электрическую схему.
QElectroTech поддерживает импорт из QET и XML файлов, а экспортировать можно в QET и несколько графических форматов (PNG, JPG, BMP, SVG).

Merkaartor - редактор карт для OpenStreetMap.org, карт всего мира, которые может редактировать любой человек.
Возможности:
✔скачивание и отправка данных на сервер OpenStreetMap
✔открытие файлов .osm и .gpx
✔создание и перемещение точек, линий и областей
✔добавление тегов, удаление объектов
✔изменение направления, разбиение и объединение линий
✔визуализация некоторых областей leisure/landuse и типов дорог
✔отображение информации GPS

Есть возможность создать свою физическую модель, приложить различные силы и запульнуть какой-нибудь кубик далеко и надолго

XaoS позволяет изменять масштаб изображения и перемещения по фрактальной в реальном времени. Он может отображать анимированные фракталы в графическом или даже режиме обычного текста.
Он отображает множество Мандельброта и многих других фракталов и позволяет увеличивать плавно переходит фрактал. Различные варианты окраски предназначены для обеих точек внутри и за пределами выбранного набора. Кроме того, переключение между Мандельброта и Жюлиа фрактальных типов предоставляется.
Другие функции включают режим автопилота, палитра меняется, сохранения снимка, фрактальная инверсии, фильтры и построен в фрактальной учебник